Debido a la crisis del coronavirus, la Tercera riojana debe cambiar su formato de cara a la esta temporada. La pandemia hizo que no hubiera descensos en la pasada campaña, así que veintidós equipos participarán en la competición.
Todos ellos se dividirán en dos subgrupos de once. A partir de ahí, la primera fase constará de veintidós jornadas, con enfrentamientos todos contra todos y a doble vuelta. Al ser un número impar, serán veinte partidos y dos descansos para cada conjunto.
La nueva Tercera División se dividirá en dos fases
Subgrupo A: CD Varea, CD Arnedo, Anguiano, Oyonesa, Alfaro, CD Berceo, Vianés, Comillas, La Calzada, Villegas y CD Agoncillo.
Subgrupo B: Casalarreina CF, UD Logroñés B, Náxara CD, Calahorra B, River Ebro, CD Pradejón, CD Alberite, Calasancio, Yagüe CF, Racing Rioja y Tedeón.